В счет-фактуре можно создать отдельное поле, чтобы там автоматически по сумме документа считался налог с рекламы. Это можно сделать так:
- добавить отдельную папку для счетов-фактур, в которых учитывается налог с рекламы (если у Вас есть "обычные" счета-фактуры):

- добавить на эту папку расширение для отображения налога с рекламы:

- добавить калькуляцию, чтобы налог с рекламы считался автоматически:

- "прикрепить" добавленную калькуляцию к нужной папке:

Тогда после сохранения счета у Вас посчитается налог с рекламы:

Примечание: Если Вам нужно учитывать налог с рекламы в проводках или журналах регистрации (например, для корректного расчета акта сверки или реестра), то нужно донастроить проводки или регистрацию в журналах, чтобы к сумме документа прибавлялся НДС и налог с рекламы.