Это не большие погрешности, а законы математики, и Вам как бухгалтеру должно быть это известно.
Вычислите 33,2% из сумм по каждому сотруднику и сложите полученные данные - результат будет такой, какой выдала машина. И он будет более правильный, чем вычислить 33,2% из общей суммы, как сделали Вы.
Пример попроще: посчитайте НДС для 100 карандашей стоимостью по 3 коп, то есть общая сумма 3 грн.
3грн*0,2=0,60грн
и
3коп*0,2=1коп
1коп*100=1грн
Вот тут уже погрешность побольше будет