Дебет Плюс

Как можно в одном счете отразить операции с НДС и без НДС?

В справочнике номенклатуры для тех номенклатур, что не облагаются НДС, следует поставить "Процент НДС"=0
Тогда в накладных при расчете суммы НДС по документу суммы по данным номенклатурам будут "пропускаться".

процент снимал. просто в самой форме редактирования счета есть только вариант С НДС, или БЕЗ НДС и НДС добавляет даже тем позициям у которых в справочнике номенклатуры стоит 0% НДС.

При редактировании накладной следует выбирать вариант "с НДС".
При редактировании номенклатуры процент НДС указывать на вкладке "Дополнительно", а не "Расширения" , где он остался из соображений совместимости со старыми версиями, и может быть отключен в списке расширений справочника номенклатуры.

НДС менял именно на этой вкладке. Все равно все подбивает с НДС =(

еще один вопрос, как в форме печати можно отдельно вывести только одну номенклатуру из списка которые есть в счете?

1. По поводу НДС - скиньте контактный номер телефона "в личку" - похоже, что какие-то проблемы конкретно с вашей версией/настройкой. Мы перезвоним и попытаемся разобраться.
2. По поводу печати одной номенклатуры из нескольких.
Если я правильно понял, то вам нужно напечатать какую-то конкретную строку из нескольких имеющихся в счете.
Для этого следует указать условие печати. Проще всего будет, если надо печатать строку с какой-то конкретной номенклатурой.
Тогда для строки надо указать условие вида:

tfnmk("COD", RTNMK)=="01.02.03"

где "01.02.03" - это код номенклатуры, чью строку следует печатать
Можно проще: Если в справочнике узнать ID номенклатуры, то можно просто

RTNMK==123456789

где вместо 123456789 следует поставить ID номенклатуры.

По поводу того, где указывать условие - зависит от типа формы печати.
Советую ознакомиться со статьей "Организация печати в системе"
"Организация печати в системе"

Для jrxml форм гляньте на раздел 7.4. "Свойства ячейки" - там на скриншотах присутствует поле "Print when expression" - в него и пишите.