А так же заметил другую проблему.
в связи с тем что неудачная попытка разархивации данных привела базу в негодность, начал создавать новую базу, для импорта в нее данных.
После процедуры импорта в чистую базу автоматом запускается процедура модификация структур данных.
После окончания первого этапа (модификация отмеченных таблиц) процедура виснет, и не переходит наследующий этап (например на "сверку с эталоном").
Пробовал в разных вариантах, на разных базах, и пару раз ждал по часу, проблема не исчезла.
А если проходить процедуру "модификация структур данных" по базе которая уже существовала на момент установки версии Дебет+ с MySQL сборка 12.0.18. (т.е. речь об установке "поверх" старой версии), то такая проблема не возникает.
Предполагаю что ошибка не в моей базе, а в системе, так как описанная проблема возникает и без импорта, а на создании пустой базы, в данной версии сборки (на предыдущей версии такие же действия ошибки не выдавали)